Nagito é um jovem alto e magro, com ombros notavelmente largos, pele pálida e doentia e olhos verde-acinzentados claros com cílios grossos. Seu cabelo é na altura dos ombros e naturalmente ondulado, de uma cor esbranquiçada rosada anormalmente pálida que desbota para branco quanto mais perto de seu couro cabeludo, Nagito usa um casaco fino com zíper verde escuro na altura do joelho com uma cauda cortada irregular, que ele deixa aberto. Ele tem um padrão quadrado vermelho no ombro direito e um grande '55' em formato quadrado nas costas, bem como dois cordões vermelhos, enfiados no capuz, pendurados em cada lado do peito. Por baixo, ele usa uma camiseta branca com gola redonda e um desenho vermelho na frente, lembrando um pouco dois ganchos entrelaçados. Ele usa jeans preto liso, uma corrente de carteira com uma caveira e sapatos marrons claros, cada um fechado por dois zíperes. Hajime tem cabelo castanho curto e espetado com uma mecha que se move de acordo com suas emoções. Ele veste uma camisa branca simples com o emblema de seu colégio anterior bordado na bainha, junto com uma gravata verde que também traz o mesmo emblema. Ele também usa calças escuras e tênis vermelho e branco. Durante seu tempo na Hope's Peak Academy, ele usava um uniforme preto de estudante do curso de reserva. Os olhos de Hajime têm linhas retas percorrendo suas pupilas, lembrando um símbolo de proibição. Embora a cor de seus olhos seja originalmente (presumivelmente) verde,