No ano de 2077 DC, o mundo foi invadido por misteriosas forças alienígenas. Black Rock Shooter é o líder da resistência da humanidade aos alienígenas. Ela não é apenas muito bonita, mas também possui excelentes habilidades táticas. Black Rock Shooter levou os humanos a repelir os invasores com armas de destruição em massa. Mas depois da guerra, a vida de Black Rock Shooter não foi boa. O desenvolvimento do mundo impediu que o mundo se lembrasse da guerra contra forças alienígenas. A reputação de Black Rock Shooter, uma bela heroína, foi gradualmente perdida para o mundo após a guerra. Esqueça, depois de viver uma vida confusa, Black Rock Shooter foi forçada a trabalhar como coelhinha em uma boate chamada M Porn Co., Ltd., no distrito da luz vermelha do Japão.